أنشئت كلية العلوم عام 1976، بالتزامن مع إنشاء الجامعة وكانت جزءاً من كلية العلوم والآداب، حيث تم فصلهما إلى كليتين مستقلتين عام 1981. تضم الكلية حالياً سبعة أقسام أكاديمية هي: الرياضيات، الفيزياء، الكيمياء، الإحصاء، العلوم الحياتية، وعلوم الأرض والبيئة، وقسم المساقات الخدمية العلمية. تمنح جميعها درجتي البكالوريوس والماجستير في التخصص باستثناء قسم المساقات الخدمية العلمية، كما يمنح قسم الفيزياء درجة البكالوريوس في الفيزياء الطبية منذ مطلع العام الجامعي 2004/2005، ودرجة الماجستير في الفيزياء النووية اعتباراً من بداية العام الجامعي 2011/2012، ويمنح قسم العلوم الحياتية درجة الماجستير في تخصص التقانات الحيوية منذ بداية العام الجامعي 2003/2004. أما قسم المساقات الخدمية العلمية فقد أنشيء عام 2017 لخدمة متطلبات الجامعة الاختيارية، ولا يمنح أي درجة علمية. ويبلغ عدد الطلبة الذين يواصلون دراستهم لمرحلتي البكالوريوس والماجستير لعام 2015/2016 (2679) طالبا وطالبة، فيما بلغ عدد أعضاء الهيئة التدريسية (169) عضو بمختلف الرتب الأكاديمية. تُعنى الكلية بمتابعة تحديث الخطط الدراسية لأقسامها المختلفة، حيث تم تزويد المختبرات بأحدث الأجهزة اللازمه، وحصلت الكلية عام 1998 على منح من المجموعة الأوروبية والبنك الدولي لتطوير برامج التدريس لمرحلة البكالوريوس بما يتناسب مع تطورات العصر ومتطلبات المجتمع المحلي. ويتبع للكلية متحف التاريخ الطبيعي الأردني الذي يوثق للحياة الطبيعية في الأردن من حيوانات ونباتات وصخور ومعادن وأحافير، وتضم الكلية العديد من المختبرات العلمية البحثية والمتخصصة التي تسهم في رفع سوية البحث العلمي وكفاءة الطلبة العلمية.